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Le Cirad recrute un.e technicien.ne en phytopathologie pour l'UMR PHIM (Plant Health Institute of Montpellier). Au sein de cette unité de recherche et du pôle ITEM (Interaction, evolution and mechanisms), l'équipe FBI (Fungal and Banana Interactions) a pour objectif de comprendre l'émergence de maladies fongiques du bananier et l'évolution des interactions hôte-pathogènes. L'objectif appliqué est de définir des stratégies durables d'utilisation des résistances variétales pour limiter l'utilisation de pesticides. Deux maladies émergentes considérée aujourd'hui comme les principales menaces de cette culture sont étudiées dans l'équipe : la maladie foliaire dite des raies noires causée par Pseudocercospora fijiensis (Pf ) et la maladie vasculaire appelée fusariose et causée par Fusarium oxysporum fsp cubense (FOC). Vous fournirez un appui technique en mycologie, phytopathologie et biologie moléculaire à ces recherches avec :

- L'isolement, l'identification, le stockage, et la caractérisation biologique des champignons parasites du bananier étudiés dans l'équipe FBI. Vous participerez à la gestion des collections uniques de ces microorganismes.
- La réalisation des expérimentations de phénotypage des interactions entre ces champignons et le bananier en utilisant des méthodes de phytopathologie et d'analyse d'image basées sur le ‘Deep Learning.'
- La mise en œuvre des techniques de biologie moléculaire pour réaliser des diagnostics moléculaires complémentaires, du génotypage par séquençage, du séquençage de génomes complets et la génération de mutants.
- Le partage de votre savoir-faire en mycologie et phytopathologie avec les autres équipes du pôle Item.
- La contribution à la formation en phytopathologie/mycologie des partenaires du Sud accueillis à Montpellier et au travers de formations collectives à l'étranger.
- La participation à la gestion et à la maintenance des laboratoires (réglementation hygiène et sécurité, suivi équipements, stocks consommables, …).

Diplôme bac +3/+2 exigé, avec une formation de type licence Pro, BTS ou DUT dans les domaines de la microbiologie, biotechnologie ou biologie moléculaire
Compétences techniques :
Formation et expérience en microbiologie requises
Maitrise des concepts de base et expérience en biologie moléculaire (extraction ADN/ARN, PCR, génotypage) requise
Connaissances en phytopathologie appréciées
Connaissances en analyses d'image appréciées
Expérience en techniques de génotypage et/ou séquençage à haut débit appréciée
Autres compétences/ savoir être :
Maîtrise et utilisation des bonnes pratiques de laboratoire requise
Maîtrise de l'anglais scientifique (écrit et parlé) requise
Maîtrise des outils informatiques de base requise
Expérience et goût prononcé pour le travail en laboratoire et en équipe requise
Capacité de synthèse, savoir rassembler et mettre en forme les résultats des expérimentations requise
Bonne autonomie, capacité d'adaptation à de nouveaux outils requise
Expérience et sensibilité à la gestion des données (principes FAIR) appréciée

Merci de bien vouloir indiquer dans votre CV des références de responsables sur de précédentes fonctions que nous nous permettrons de contacter

Nos atouts ·

Scientifiques/sociétaux : Vous intégrerez une des unités de recherche en phytopathologie principales de France qui, de façon unique, fait le lien entre des problématiques du nord et du Sud (https://umr-phim.cirad.fr/). Au sein de cette unité, vous travaillerez dans une équipe dynamique intervenant dans des gros projets, constituée de 8 permanents et habituellement de 3 à 4 non permanents (https://umr-phim.cirad.fr/recherche/interactions-plante-microorganismes-item/equipe-fbi). Les résultats de nos recherches contribuent à la diminution de l'usage des pesticides dans le cadre conceptuel d'une santé.
Avantages sociaux : Vous bénéficiez d'un 13ème mois, de possibilité de journées de télétravail, d'horaires personnalisables et d'une assurance sociale complète.