Le flétrissement bactérien (fb) est une pathologie végétale bactérienne causée par le complexe d'espèces Ralstonia solanacearum (ceRs) chez de nombreuses plantes notamment les Solanacées d'intérêt agronomique. Dans le sud-ouest de l'océan Indien, cette maladie figure parmi les plus dévastatrices des cultures vivrières et de rente et les moyens actuels de lutte demeurent peu efficaces. L'utilisation de bactériophages pourrait constituer une perspective crédible de biocontrôle du fb, mais le premier verrou scientifique à lever concerne la caractérisation de la diversité des virus spécifiques du ceRs qui reste à l'heure actuelle peu connue.

Dans le cadre du projet Epiphages-OI, différents échantillonnages sur le terrain vont être réalisés dans le but de caractériser la diversité génétique du couple ceRs-bactériophages.

Vous participerez aux missions d'échantillonnages sur le terrain. Vous serez en charge d'assurer la culture des souches bactériennes et des bactériophages au laboratoire en utilisant des techniques de microbiologie et de virologie, de leur isolement initial jusqu'à la mise en collection. Vous serez également en charge d'analyses de typage génétique utilisant des techniques de biologie moléculaire telles que l'extraction et le dosage d'acides nucléiques, la PCR et le séquençage. Finalement vous aurez l'opportunité de participer à des expérimentations d'application de bactériophages sur plantes.

Niveau Bac +5 en sciences du laboratoire (microbiologie/phytopathologie), avec des connaissances indispensables en bacteriologie, virologie, ou biologie moleculaire.

Vous avez de l'expérience dans l'isolement et la manipulation de microorganismes (bactéries, virus). Travail en équipe. Bon relationnel.

Permis B obligatoire